एकीकृत कृषि प्रणाली के विभिन्न अवयव ये हैं :

• खेत के कुंड या तालाब
• जैव कीटनाशक और उर्वरक
• वर्मी कम्पोस्ट बनाना
• वर्षाजल संग्रह या रेनवॉटर हार्वेस्टिंग
• फसलें
• पशुधन
• पक्षी
• वृक्ष
• एकीकृत कृषि प्रणाली में कई प्रकार से फसलें उगाई जा सकती हैं जिनमें नीचे लिखे प्रकारों में से कम से कम दो या अधिक हो सकते हैं – एकल फसल, मिश्रित/अंतरफसल, अनाजों की बहु-श्रेणी फसलें, फलियां (दलहनें), तिलहन, चारा इत्यादि।
• पशुधन में शामिल हो सकते हैं – दुधारू गायें, बकरी, भेड़, मुर्गा, मधुमक्खियां
• वृक्षों में इमारती लकड़ी, ईंधन या जलावनी, चारे और फल के पेड़ शामिल हो सकते हैं।

विभिन्न कृषि-पारिस्थितिकी तंत्रों के लिए एकीकृत कृषि प्रणाली के भिन्न-भिन्न अवयवों का उपयोग किया जाता है, अर्थात शुष्कभूमि खेली के लिए डेयरी-मुर्गीपालन-बकरी/भेड़पालन-कृषिवानिकी-खेतपोखरा सबसे अच्छा संयोजन है, जबकि तरभूमि कृषि के लिए डेयरी-मुर्गीपालन-कुकुरमुत्ता-मधुमक्खीपालन-मछलीपालन-बत्तखपालन सबसे अच्छा संयोजन है।